Desde el punto de vista de la vegetación, en el Parque se encuentran las formaciones vegetacionales Bosque Caducifolio de Aysen, en la que las especies características son Lenga (Nothofagus pumilio) y Ñirre (N.antartica), siendo frecuentes también el Coigüe común (Nothofagus dombeyi) y el Coigüe de Magallanes; Matorrales Periglaciares donde predominan especies como el Ñirre (Nothofagus antártica), Nalca (Gunera magellánica), Mata negra(Chilotrichum difusum) Helechos (Blechnum penna-marina) y Turberas y Matorrales Siempreverdes Pantanosas del Canal Messier, en la que las especies representativas son Oreobolus obtusangulus y las acompañantes Empetrum rubrum y Donatia fasicularis. En cuanto a la Fauna, destacan las aves de las familias Spheniscidae (pinguinos), Procellaridae (Petreles), Phalacrocodacidae (Cormoranes), Anatidae (patos), Troglodytidae (chucao) Turdidae (zorzal) Picidae (Matín pescador) y Cathartidae (Cóndor) entre otras. Entre los mamíferos destacan el Huemul (Hippocamelus bisulcus), Chungungo (Lutra provocax), Lobo marino (taria flavescens), Lobo marino de dos pelos (Arcthocephalus australis),Guiña (Oncyfelis guigna), Puma (Felis concolor) y Ratón colilargo (Oligoryzomis longicaudatus) entre los más comunes. La unidad no cuenta con infraestructura en la Región, siendo los guardaparques destacados en Caleta Tortel y Villa O'Higgins los encargados de su protección. El Parque Nacional Laguna San Rafael, fue creado en 1959, sus límites y superficie actual de 1.742.000 ha., se fijaron en 1983, constituyéndose así en el mayor Parque Nacional de la Región. Debido a la relevancia de los recursos naturales que posee, en 1979 fue declarado Reserva Mundial de la Biosfera por UNESCO. Localizado entre el río Exploradores, río Baker, Lago General Carrera y Golfo de Penas, comprende parte de la provincias de Aysén, Capitán Prat y General Carrera, siendo accesible por vía marítima y aérea. El Parque comprende algunas de las de las mayores alturas de los Andes australes, como el Monte San Valentín con 4.058 m.s.n.m., y los cerro Arenales, Hyades, y Pared Norte entre otros. La totalidad de los campos de Hielo Norte y del San Valentín se encuentran dentro del Parque, dando origen a varios ventisqueros, entre los que destacan el San Quintín, San Valentín, Hualas, Leones, Soler, Steffens, Jorge Montt y el San Rafael, con una longitud de 18 km., aproximadamente, y un frente de avance de 4 km. de ancho y 60 m. de alto.